U drugom kolu završnice Kupa Federacije BiH učestvuje 24 kluba, od toga učestvuje 16 klubova članova m:tel Prve lige Federacije BiH u takmičarskoj sezoni 2020/2021, te osam najuspješnijih klubova pobjednika utakmica prvog kola.
Voljom žrijeba u drugom kolu završnice seniorskog Kupa Federacije BiH sastaju se:
FK Unis Vogošća – NK Jedinstvo Bihać
NK Fortuna Zenica – NK Slaven Živinice
NK Kiseljak – NK Gošk Gabela
NK Krajišnik Velika Kladuša – FK Goražde
FK Dizdaruša Brčko – HŠK Posušje
FK Radnički Lukavac – HNK Čapljina
NK Ljubuški – FK Budućnost Banovići
FK Klis Buturović Polje – NK Bratstvo Gračanica
NK Tošk Tešanj – NK Zvijezda Gradačac
HNK Orašje – NK Travnik
FK Rudar Kakanj – FK Radnik Hadžići
FK Igman Konjic – NK Vis Simm Bau Kosova
Utakmice drugog kola završnice seniorskog Kupa FBiH igraju se danas, 15. 09. 2020., konkretno meč između Radničkog iz Lukavca i Čapljine, te preostali mečevi 16.09.2020. godine u 16:30 sati, a shodno parovima drugog kola Kupa FBiH, jasno je da su četiri prvoligaša garantovano izborili plasman u Kup BiH.
